"הרי ירושלים" מציע מגוון פעילויות טיפוליות המשלימות את הטיפול הפרטני האינטנסיבי שכל ילד מקבל. פעילויות טיפוליות המתקיימות מחוץ לפנימייה מאפשרות לילדים לקחת צעדים ראשונים לקראת עצמאות וחיבור מחודש עם הקהילה הרחבה יותר. השתתפות בפעילויות אלה גם מספקת לילדים תחושה של שליטה והישגיות. הילדים מקבלים כלים להתמודדות עם מצבים מאתגרים, מפתחים ביטחון ביכולתם לעצב את החוויות שלהם ולומדים לסמוך על אחרים. מיומנויות אלה יסייעו להם כשישתלבו מחדש בחברה הנורמטיבית ויתחילו לבנות חיים משלהם.